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软件系统和应用系统以及应用软件和系统软件在概念和功能上存在明显的区别。
1、软件系统：通常指的是一系列计算机程序的集合，这些程序用于管理和控制计算机的硬件、软件资源以及数据的操作，软件系统包括操作系统、数据库管理系统、编程工具等，它们共同协作，使得计算机能够高效地运行各种应用。
2、应用系统：是指为解决特定业务问题而开发的一系列软件的集合，这些软件通常包括特定的功能模块，用于处理特定的业务需求，一个电子商务系统就是一个应用系统，它包括商品展示、订单处理、支付等功能模块。
在区别上，软件系统更多地关注于计算机的基础运行和管理，而应用系统则更关注于解决特定的业务问题。
至于应用软件和系统软件的根本区别，主要在于：
1、目的：应用软件是为了满足用户某些特定的业务需求或活动而开发的软件，如办公软件、图像处理软件等，而系统软件则是为了管理和控制计算机的硬件、软件资源而开发的软件，如操作系统、设备驱动程序等。
2、功能：应用软件通常提供特定的业务功能或服务，帮助用户完成特定的任务，而系统软件则负责计算机系统的基本操作和硬件管理，为应用软件提供运行的环境。
软件系统和应用系统在计算机领域各有其独特的定义和作用，而应用软件和系统软件的主要区别在于它们的目的和功能。